聚集Xevo MRT多元运用|运用代谢组学研讨回答骨骼发育与代谢谜题
具有超卓的全体功能,很合适代谢组学研讨范畴。本运用展现了科学家们经过对细胞外囊泡(EV)和基质结合囊泡(MBV)代谢测定来研讨骨骼发育及其代谢的难题。
细胞外囊泡(EV)是由脂质限定性的纳米颗粒,在机体的发育和细胞间信号传递事情中发挥效果。骨骼中存在一个名为基质结合囊泡(MBV)的EV子集。长期以来,人们一向以为其与下方的胶原性细胞外基质缔合,以驱动骨骼发育过程中的前期钙化事情。可是,EV和MBV之间的准确联系及其在骨骼发育和代谢中的不同效果任旧存在争议。
,在成骨培育条件下,剖析从MC3T3前成骨细胞平排泄出的细胞外囊泡(EV)和基质结合囊泡(MBV)并生成比较代谢物谱。
图1. Xevo MRT 是一款台式超高分辩质谱仪,选用创新式离子光学元件规划和多反射飞翔时刻技能。
软件渠道内选用数据非依靠型剖析(DIA)形式收集数据,质量范围为50-1,200 Da,扫描速度为10 Hz,高能磕碰阶梯为25-45 V,选用正/负电喷雾电离(ESI)形式。
数据处理:在waters_connect MS Toolkit运用程序中将数据来进行可视化,并经过MARS软件(代谢组学处理软件p/n:176005424)进行计算处理,运用HMDB数据库进行化合物判定。
图2. MARS生成的PCA图展现运用HILIC色谱别离EV(绿色)和MBV(蓝色)的成果。该体系运用NIST尿液规范品(赤色)作为QC样品。
图3. 火山图,显现HILIC剖析中MBV(左)和EV(右)提取物中极性代谢物的上调。
图4. MARS生成的PCA图展现了运用RP色谱别离EV(绿色)和MBV(蓝色)的成果。该体系运用NIST尿液规范品(赤色)作为QC样品。
图5. 火山图,显现RP剖析中MBV(左)和EV(右)提取物中极性代谢物的上调。
图6. 3-b-吡喃半乳糖基葡萄糖的同位素峰簇质谱图。研讨之后发现,脂肪酰糖苷在MBV中的表达是EV中的约50倍。
图7. 来自MARS的判定示例,显现1-棕榈酰磷脂酰胆碱(LPC 16:0)的匹配,比较于MBV,这种磷脂在EV中上调约5倍。
分辩率更高:Xevo MRT质谱仪的高质量分辩率能别离m/z值十分类似的物质,然后添加检测到的化合物数量。
可信度更强:高质量精度可削减过错的数据库匹配成果数量,并为组学运用中的揣度性判定供给了可信度。
Xevo MRT质谱仪凭仗其超卓的质量分辩率和简略易用的配套数据处理办法,生动出现了高度类似的EV和MBV之间的差异,为解开骨骼发育与代谢的谜题供给了钥匙。
Xevo MRT质谱仪选用SELECT SERIES™ MRT质谱仪上初度完成商业化的多反射飞翔时刻(MRT)技能,分辩率可达100,000 FWHM,质量精度可达亚ppm级,扫描速度达100 Hz,惊人的功率和超卓的功能为您的科学研讨注入微弱动力。
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