研讨人员开发出新的N-和O-糖蛋白组学剖析办法—小柯机器人—科学网

  美国密歇根大学Alexey I. Nesvizhskii研讨团队开发出新的N-和O-糖蛋白组学剖析办法。该项研讨成果于2020年10月5日在线宣布在《天然办法学》杂志上。

  研讨人员提出了MSFragger-Glyco，一种MSFragger查找引擎的糖蛋白组学形式，用于快速活络地辨认N-和O-衔接的糖肽和开放式聚糖查找。从头剖析最近的N-糖代谢组学数据使得注释的糖肽谱匹配数（glycoPSM）比曾经报导的多80％。在已发布的O-glycoproteomics数据中，当查找与原始查找相同的聚糖时，这一办法所标示的glycoPSM的数量添加了一倍以上，而当扩展查找以包括其他聚糖成分和其他润饰时，这一办法完成了4至6倍的添加。

  扩展的查找规模还显现了许多硫酸化和杂乱的聚糖，它们依然保留在原始查找规模内。MSFragger-Glyco极大地改进了谱注释，并结合了根据索引的评分速度，然后可以全方面剖析糖蛋白组学数据并说明糖基化的许多效果。

  据悉，完好糖多肽的富集和质谱剖析办法现已产生了大规模的糖蛋白组学数据集，可是解说这一些数据依然具有挑战性。